Ydinpolysakkaridin synteesi alkaa lipidistä Ⅳ a. Kun KDO (ydinoligosakkaridi) on lisätty ei-pelkistävän glukosamiinin C-6-asemaan, lisätään vähitellen heptoosia ja heksoosia.

1. KDO:n synteesi ja adheesio

KDO:n synteesi sisältää kolme jatkuvaa reaktiota: ① 5-fosfaatti-D-riboosi ↔ 5-fosfo-D-arabinoosi. ② 5-fosfaatti - D-arabinoosifosfoenolipyruvaatti → 8-fosfaatti - KDO-fosfaatti. ③ 8-fosfaatti - KDO-alkaanihappo. Nämä kolme reaktiota suoritettiin vastaavasti 5-fosfo-D-nukleaatti-isomeraasin, 8-fosfori-KDO-syntetaasin ja 8-fosfataasin katalyysin alla. Lapsen geeni, joka sijaitsee 27 minuutin kohdalla kromosomista, koodaa 8-fosfori-KDO-syntetaasia.

KDO tuottaa CMP-KDO-aktivoitua muotoa CMP-KDO-syntetaasin katalyysin alaisena. Tätä reaktiota katalysoivaa entsyymiä koodaa kds B -geeni, joka sijaitsee 85 minuutin kohdalla kromosomista. CMP-KDO sitoo KDO:n lipidin Ⅳa C-6:een kaksois- tai kolmifunktioisen proteiinin WaaA katalyysin alaisena ja lisää sitten toisen KDO-molekyylin ensimmäiseen KDO-molekyyliin.

2. Heptoosi- ja heksoosialueiden synteesi

Ydinpolysakkaridiin lisätään heptoosia yksitellen ADP-aktivoinnin muodossa ja heksoosia UDP-aktivaation muodossa. Nukleotidimonosakkarideja katalysoivat glykosyylitransferaasit kuuluvat sarjaan kalvoon liittyviä glykosyylitransferaaseja, jotka siirtävät sokeriryhmiä kypsiin lipidi A -molekyyleihin solukalvon sytoplasmisella pinnalla. Syntetisoitu lipidi A:n ydinmolekyyli voidaan siirtää solukalvon sytoplasmapinnalta solukalvon periplasmiselle pinnalle ABC-kuljetuslaitteen [ATP-sidoskasetti (ABC) -kuljettaja] mukana ja saattaa kytkentäreaktio loppuun. O-antigeenipolysakkaridiketjun kanssa periplasmisella pinnalla täydellisen LPS-molekyylin muodostamiseksi. Lisäksi lipidi A-ydintä voidaan käyttää myös enterobakteerien yhteisen antigeenin (ECA) ja Escherichia coli -ryhmän kapseli-K-antigeenin polysakkaridiketjun reseptorina.

Ydinpolysakkaridien synteesiin osallistuvia glykosyylitransferaaseja tai modifioivia entsyymejä koodaa geeniluokka wa ※ ※, jotka sijaitsevat kromosomin 81-82 minuutin kohdalla, cysE- ja pyrE-geenien välissä, ja nämä geenit jakautuvat kolmeen operoniin. . Escherichia colin viiden ydinrakenteen osalta eri ydinsynteesien geenikoostumus ja geneettinen jakautuminen ovat erilaisia.

waaA-operoni sisältää rakennegeenin waaA, joka koodaa bifunktionaalista tai trifunktionaalista KDO-transferaasia ja polypeptidigeenin, jonka funktio on tuntematon ja jonka suhteellinen molekyylipaino on 18000. gmhD-, waaF- ja waaC-geenien tuotteet gmhD-operonissa liittyvät synteesiin ydinheptoosialueen, kun taas waaQ-operoni liittyy ulomman heksoosialueen synteesiin ja ydinalueen kemialliseen modifikaatioon. Escherichia coli K-12:ssa gmhD-operonin transkriptiota säätelee lämpösokkipromoottori ja minkä operonin transkriptiota säätelee positiivisesti operonin ylävirtaan transloimaton alue ja transkription elongaatiotekijä RfaH.