LBP (lipopolysaccharide-binding protein) on glykoproteiini, jonka suhteellinen molekyylipaino on 60 000. Sen proteiinirakenne on yksiketjuinen polypeptidi, jonka suhteellinen molekyylipaino on 5 000. Se käy läpi glykosylaatioreaktion Golgin kehossa ja erittyy vereen kypsyyttä tulla glykoproteiiniksi. LBP ei ole lämmönkestävä, ja sen aktiivisuus on yleensä vakaa 50 ℃:ssa, ja noin 50 % sen aktiivisuudesta menetetään 53-56 ℃:n välillä. Kun hiiren seerumi tai hiiren puhdas LBP kuumennettiin 59 ℃:seen, aktiivisuus hävisi kokonaan. Ihmisen plasma on herkkä lämmölle. Yleisin menetelmä komplementin inaktivoimiseksi (56 ℃, 30 min) voi johtaa LBP:n biologisen aktiivisuuden menettämiseen 70 %.

Tällä hetkellä on selvitetty, että ihmisen LBP-proteiinin aminohapposekvenssi on kypsä proteiinipolypeptidiketju, joka koostuu signaalisekvenssipeptidistä, jossa on 25 aminohappotähdettä ja 452 aminohappotähdettä. Polypeptidiketjussa on neljä kysteiiniä ja viisi glykosylaatiositoutumiskohtaa, jotka sijaitsevat vastaavasti polypeptidiketjun kohdissa 275-277, 325-327, 330-332361-363 ja 369-371. Kanin LBP:n proteiinirakenne on hyvin samanlainen kuin ihmisen. Se koostuu myös hydrofobisesta polypeptidiketjusta, joka koostuu 26 aminohappotähteestä, ja proteiinipolypeptidiketjusta, joka koostuu 456 aminohappotähteestä. Sen aminohapposekvenssi on erittäin homologinen ihmisen aminohapposekvenssin kanssa, sillä 69 % on samaa aminohapposekvenssiä; Nukleotidisekvenssi on 78-prosenttisesti johdonmukainen, mutta sisältää vain 2 kysteiiniä ja 3 glykosylaatiositoutumiskohtaa, jotka sijaitsevat vastaavasti kohdissa 275-277, 325-327 ja 361-363. LBP:n kemiallinen spatiaalinen konformaatio on edelleen epäselvä, ja se voi olla samanlainen kuin BPI (bakterisidinen/läpäisevyyttä lisäävä proteiini).