Tyypillinen suoliston bakteerilipidi A on 1,4-difosfaatti-β1,6-sitoutuneet glykosaminodisakkaridit pääketjuna ja kytketyt 3-hydroksirasvahapot tai 3-asyylikarboksyylitähteet, joissa on amidi- ja esterisidoksia. Tämä rakenne ei ole yhteinen kaikille gram-negatiivisille bakteereille. Erityisesti yllä olevia rakenteita ei usein tavata perheissä, jotka ovat kaukana koliformisista bakteereista, kuten Bradyrhizobiasta.

Aluksi johdetun lipidi A:n rakennetta pidettiin "epänormaalina" lipidi A -tyyppinä, ja nyt se nimettiin uudelleen lipidi A -variantiksi. Esimerkiksi Thiobacillus, Rhizobiaceae, Nitrobacter, Brucella, Chromatim Party, Chlorobium N ad son jne. LPS:n luurankorakenteessa ja sen substituutiossa on ilmeisiä muutoksia. Lipidi A -variantilla on siirtymätyyppinen (tai muunnettu) muoto, Rhodobacter sphaeroidesissa vain osa amidisidoksesta 3-hydroksirasvahaposta on korvattu 3-oksimyristihapolla. Lipidinä, A-runkopolysakkaridina, pigmentoituneiden bakteerien glykosamiiniin liittyy aina pieni määrä 2,3-diamino-2,3-dideoksi-D-glukoosi (DAG) -yhteyttä.

DAG:ta on vain lipidi A -rungossa. 2,3-diamiini-2,3-dideoksheksoosin uronihappojohdannaisen on raportoitu olevan Pseudomonas aeruginosan eri serotyyppien bakteeriantigeeni (O-ketju).

3- oksimyristihappo: 3-oksimyristihapon esiintyminen raportoitiin ensimmäisen kerran Listenella anguillarum- ja erytroidibakteerissa. Nyt itse asiassa kaikki gram-negatiivisten bakteerien α-3-haarojen lajit ja kannat voidaan havaita.

Endotoksiini, jolla on merkittävin biologinen vaikutus, on heterogeeninen LPS, jota käytetään usein standardina solureaktion testaamisessa ja terapeuttisen vaikutuksen tutkimuksessa. Sen biologisen aktiivisuuden osa lipidi A koostuu β-1,6:sta, joka koostuu D-glukosamiinidisakkaridista ja kuudesta tyydyttyneestä rasvahaposta ja kahdesta negatiivisesti varautuneesta fosfaattiradikaalista. Muutokset näiden rakenteiden järjestelyssä, kuten varausten lukumäärän väheneminen, rasva-asyyliryhmien vähentyminen, rasva-asyyliketjujen jakautumisen muutos ja rasva-asyylikyllästymisaste voivat johtaa niiden biologisen alenemiseen. toimintaa. Se osoittaa, että endotoksiinin primäärirakenteen muutos vaikuttaa väistämättä sen fysikaalis-kemialliseen toimintaan. Seydel et ai. vahvisti, että LPS:n stereorakenne endotoksiinissa liittyy läheisesti sen biologisiin vaikutuksiin. Erilaiset kolmiulotteiset rakenteet voivat tuottaa erilaisia ​​vaikutuksia. Yleisesti ottaen kartiomainen tilarakenne johtaa usein solujen aktivaatiovaikutukseen, kun taas LPS:n sylinterimäinen tilarakenne on usein endotoksiinin antagonisti, joka estää solujen aktivoitumisen.