Kun O-antigeenipolymeeri on liitetty lipidi A:n ytimeen, se pysäyttää polymerointireaktion. Toisin sanoen liitosreaktio voi lopettaa polymerointireaktion. Sekä lipidi A:n ydin että lipopolysakkaridi eripituisilla toistoyksiköillä voidaan siirtää tehokkaasti ulkokalvolle. Siksi lipopolysakkaridin molekyylikoko voidaan nähdä SDS-PAGE:lla, mikä johtuu erosta biosynteesijärjestelmässä eikä lähtöjärjestelmän tekijästä.

O-antigeenin sivuketjun jakautuminen eri bakteereissa on erilainen, joista osa sisältää noin 20 toistoyksikköä ja osa voi olla noin 100 toistoyksikköä. SDS-PAGE-elektroforeesissa heijastuu eri bakteerilajien eri molekyylien hopeavärjäytymisintensiteettien ero. Syy O-antigeenin sivuketjun pituuden erilaiseen jakautumiseen eri bakteereissa voi olla se, että O-antigeenin polykondensaatio- tai liitosreaktiossa on koon valintatekijä. Wzz (eli Rol tai Cld) on tärkeä proteiini, joka säätelee sivuketjun pituuden jakautumista bakteereissa, jotka syntetisoivat antigeenejä Wzy-riippuvaisen reitin kautta, mutta sen spesifinen mekanismi on edelleen epäselvä.