Se, kuinka vaikuttaa GNB:n LPS-synteesiin niin, että isäntä voi helposti tunnistaa ja poistaa LPS:n ja GNB:n, on myös toimenpide endotoksemian hoitoon. Enteogeenisessa endotoksemiassa Escherichia colilla (E.coli) on tyypillinen LPS-rakenne, joka on helppo paeta isännän fagosytoosin puhdistumareaktiosta, osoittaa endotoksiinin voimakasta biologista aktiivisuutta ja aiheuttaa erilaisia ​​toksisia vaikutuksia. Siksi endotoksiinien tutkimuksessa E. colin LPS:ää käytetään usein arvioimaan endotoksiinin biologisia vaikutuksia ja arvioimaan erilaisia ​​interventiotoimenpiteitä; Kun eksogeeninen GNB on infektoitunut, sen LPS-rakenteesta puuttuu tyypillinen LPS-rakenne ja sen toksisuus on suhteellisen alhainen, minkä isäntä on helppo puhdistaa.

Saksalainen tutkija Seydel et al. sijoitti LPS-aggregaattimakromolekyylejä fysiologiseen suolaliuokseen, käytti makrofagien erittämää IL-6:ta indikaattorina ja käytti synkrotronisäteilyn röntgendiffraktiotekniikkaa eri LPS:n kolmiulotteisen rakenteen analysoimiseen. Todettiin, että kartiorakenteen omaavalla LPS:llä on voimakas biologinen toksisuus, kun taas sylinterirakenteen kuutiokemiallisesta rakenteesta puuttuu toksisuus tai sen toksisuus on alhainen. Heksaasyylilipidi A E. colista on käänteinen kuutiorakenne, kun taas pentadaktyylilipidi A ja tetradekyylilipidi A E. colista muodostavat monikerroksisen rakenteen, ja niillä on taipumus olla lievä misellirakenne; C.jejuni-lipidi A on kuitenkin yksikerroksinen rakenne, jolla on lievä taipumus kehittyä käänteiseksi kuutiorakenteeksi. Kaikki muut lipidi A muodostavat poikkeuksetta monikerroksisia rakenteita. Jokainen suolistobakteerien lipidi A heksadekyyli on kartiomainen tai kovera, pentadaktyylilipidi on pääosin lieriömäinen ja tetradekyylilipidi A on lieriömäinen, ja sillä on taipumus kehittyä kartiomaiseksi tai kuperaksi (hydrofobisen vyöhykkeen poikkileikkaus on hieman pienempi kuin tämä hydrofiilisestä vyöhykkeestä).

Nykyiset tiedot osoittavat, että LPS:lle on yhteinen periaate endotoksiinissa. Vain lipidi A:n kartiomaisella tai koveralla fyysisellä muodolla on korkea biologinen aktiivisuus, kuten E. coli suolistossa. LPS:ltä puuttuu agonistiaktiivisuus ja se liittyy lipidi A:n lieriömäiseen muotoon. LPS:stä, josta puuttuu asyyliryhmä, ei tarkoita, että sitä voidaan käyttää antagonistina. Voi olla, että kun endotoksiini sisällytetään monosyytteihin, makrofageihin, neutrofiileihin ja dendriittisoluihin, se hydrolysoituu entsymaattisesti asyylikarboksyylihydrolaasilla (AOAH), jolloin muodostuu deasyylilipidi A, ja samalla se muuttaa kolmiulotteista morfologiaansa. Tällä hetkellä sillä ei ole myrkyllistä vaikutusta. Voidaan nähdä, että asyyliryhmien läsnäolo tai puuttuminen LPS:ssä ei tarkoita, että se olisi myrkytön. On välttämätöntä ymmärtää sen kolmiulotteinen rakenne.

Endotoksiinin biologinen vaikutus ja LPS:n negatiivisen varauksen määrä, asyyliketjujen lukumäärä, asyyliryhmän jakautuminen, asyyliketjun rasvahappokyllästysaste ja stereokonformaation muutos vaikuttavat kaikki endotoksiinin aktiivisuuteen. Tämä johtopäätös voi luoda teoreettisen perustan LPS-analogien suunnittelulle ja saada ne antagonisoimaan myrkyllisen LPS:n vaikutusta.